17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3612 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  64.16 
 
 
295 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5365  hypothetical protein  38.1 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  35.56 
 
 
285 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2374  hypothetical protein  34.95 
 
 
289 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  31.67 
 
 
290 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4821  hypothetical protein  34.41 
 
 
275 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619327  normal  0.458866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6077  hypothetical protein  34.53 
 
 
293 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1436  hypothetical protein  32.86 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3081  hypothetical protein  33.21 
 
 
283 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6080  hypothetical protein  27.46 
 
 
285 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  31.4 
 
 
183 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  31.33 
 
 
184 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  29.57 
 
 
147 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3157  hypothetical protein  57.14 
 
 
121 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.97591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3072  hypothetical protein  29.27 
 
 
130 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  32 
 
 
154 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>