21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0356 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  480  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  60.36 
 
 
237 aa  277  8e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  56.76 
 
 
246 aa  260  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  56.05 
 
 
243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  49.78 
 
 
229 aa  254  9e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  51.53 
 
 
240 aa  240  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1546  hypothetical protein  56.57 
 
 
229 aa  218  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.231581  hitchhiker  0.0000778031 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  39.02 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  41.67 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  33.66 
 
 
172 aa  63.2  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  23.86 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  29.05 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  28.36 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  33.94 
 
 
179 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  33.94 
 
 
186 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  27.84 
 
 
218 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  26.56 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  30.53 
 
 
149 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  29.91 
 
 
175 aa  42.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  26.13 
 
 
444 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0682  hypothetical protein  28.18 
 
 
202 aa  41.6  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.535938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>