16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0893 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0893  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  563  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.935843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0932  hypothetical protein  97.47 
 
 		 277 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.766418  normal  0.967393 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  79.92 
 
 		 277 aa  407  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5225  TadE family protein  54.66 
 
 		 240 aa  258  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6383  hypothetical protein  42.98 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.947676  normal  0.405337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  25.88 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  21.8 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  27.4 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  39.66 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  25.97 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  38.24 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  23.53 
 
 		 184 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  35.29 
 
 		 206 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  23.94 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  33.82 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  32.47 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>