22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0136 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  97.46 
 
 
118 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  87.29 
 
 
118 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  67.27 
 
 
113 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  48.6 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  55 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  44.86 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4127  hypothetical protein  44 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  36.79 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  39.81 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8293  hypothetical protein  41.49 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  28.57 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0485  hypothetical protein  36 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  36.36 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5156  hypothetical protein  36.78 
 
 
114 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320276  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  35.24 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0367  hypothetical protein  29.36 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46564  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0031  hypothetical protein  32.46 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3252  hypothetical protein  35.19 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6246  hypothetical protein  34.48 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.292419  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4210  hypothetical protein  36.36 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109507  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2715  hypothetical protein  31.19 
 
 
119 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.605937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>