45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0384 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  884    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  57.33 
 
 		 384 aa  93.6  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  56.34 
 
 		 448 aa  93.2  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  57.69 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  57.33 
 
 		 422 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  58.67 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  49.44 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  53.33 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  54.67 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  55.13 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  53.33 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  56 
 
 		 370 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  53.33 
 
 		 459 aa  86.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  50.63 
 
 		 440 aa  85.9  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  53.85 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  56.67 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  56.67 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  56.67 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  56.67 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  60 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  50.67 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  50.67 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  54.43 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  58.33 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  58.33 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  49.33 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  57.63 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  47.37 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  53.33 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  50 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  56.9 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  48.68 
 
 		 436 aa  73.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  54.24 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  44.44 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  46.75 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2019  hypothetical protein  30.28 
 
 		 615 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000003618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2854  hypothetical protein  30.28 
 
 		 615 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000844037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2834  hypothetical protein  30.28 
 
 		 561 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0278532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2844  hypothetical protein  30.28 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000924463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2825  hypothetical protein  29.36 
 
 		 615 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000521887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1928  hypothetical protein  28.44 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000122505  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  30.25 
 
 		 1273 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2863  hypothetical protein  29.36 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2047  hypothetical protein  28.44 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.632657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1926  hypothetical protein  28.44 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>