36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2902 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  917    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  74.15 
 
 		 414 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  75.36 
 
 		 414 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  75.36 
 
 		 414 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  64.55 
 
 		 483 aa  601  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  66.37 
 
 		 452 aa  586  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  66.35 
 
 		 425 aa  554  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  53.76 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  53.95 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  53.95 
 
 		 422 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  54.7 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  53.35 
 
 		 423 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  55.53 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  53.08 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  55.81 
 
 		 386 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  51.19 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  55.03 
 
 		 386 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  54.87 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  52.22 
 
 		 421 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  54.36 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  53.25 
 
 		 448 aa  362  7.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  52.91 
 
 		 421 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  49.89 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  50.95 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  49.1 
 
 		 436 aa  352  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  53.59 
 
 		 370 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  48.98 
 
 		 439 aa  329  8e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  45.85 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  48.03 
 
 		 450 aa  319  6e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  42.22 
 
 		 690 aa  161  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  47.4 
 
 		 443 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  43.2 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  40.09 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  30.35 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  40.1 
 
 		 509 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  56.67 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>