36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1330 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1330  large terminase  100 
 
 		 459 aa  921    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  59.52 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  62.62 
 
 		 416 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  59.18 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  62.57 
 
 		 384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  61.66 
 
 		 386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  57.86 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  62.04 
 
 		 380 aa  443  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  55.92 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  57.04 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  58.76 
 
 		 386 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  55.06 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  55.45 
 
 		 421 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  56.67 
 
 		 448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  55.93 
 
 		 414 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  56.42 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  56.42 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  55.21 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  55.08 
 
 		 452 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  57.88 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  55.8 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  51.19 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  53.04 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  50.83 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  49.03 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  52.89 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  52.36 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  51.39 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  50.13 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  39.62 
 
 		 690 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  32.31 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  45.41 
 
 		 458 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  39.51 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  41.15 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  37.5 
 
 		 509 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  53.33 
 
 		 426 aa  86.7  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>