37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3483 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  938    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  33.58 
 
 		 425 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  32.31 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  30.75 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  31.34 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  31.11 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  31.34 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  30.83 
 
 		 440 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  33 
 
 		 432 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  33.67 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  31.58 
 
 		 422 aa  150  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  30.3 
 
 		 483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  31.08 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  31.46 
 
 		 423 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  30.56 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  31.46 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  30.35 
 
 		 463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  33.42 
 
 		 421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  33.17 
 
 		 421 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  31.09 
 
 		 423 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  30.75 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  30.89 
 
 		 384 aa  136  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  30.2 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  32.97 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  30.79 
 
 		 386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  32.47 
 
 		 448 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  30.48 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  29.31 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  28.89 
 
 		 450 aa  123  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  30.25 
 
 		 370 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  25 
 
 		 458 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  28.36 
 
 		 690 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  28.35 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0667  Phage terminase large subunit, ATPase  25.28 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000088643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0605  Phage terminase large subunit  25.28 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000114589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0848  PBSX family phage terminase large subunit  25.23 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00062306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  23.88 
 
 		 443 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>