33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0192 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0192  50S ribosomal protein L15e  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237383  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2499  50S ribosomal protein L15e  74.49 
 
 
199 aa  299  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0442264  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1369  50S ribosomal protein L15e  65.46 
 
 
203 aa  275  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2385  50S ribosomal protein L15e  62.76 
 
 
196 aa  263  8.999999999999999e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1344  50S ribosomal protein L15e  65.82 
 
 
194 aa  263  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.243735  hitchhiker  0.000262392 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1681  50S ribosomal protein L15e  68.37 
 
 
196 aa  259  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0413  50S ribosomal protein L15e  63.35 
 
 
196 aa  256  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0960  Ribosomal protein L15e  59.18 
 
 
196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.359335  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1301  50S ribosomal protein L15e  66.32 
 
 
194 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.24879  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1375  50S ribosomal protein L15e  65.8 
 
 
194 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2795  Ribosomal protein L15e  57.65 
 
 
196 aa  251  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0655  50S ribosomal protein L15e  65.8 
 
 
194 aa  250  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.310615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2279  50S ribosomal protein L15e  72.45 
 
 
196 aa  248  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1500  50S ribosomal protein L15e  61.17 
 
 
194 aa  246  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0798425  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0277  Ribosomal protein L15e  57.14 
 
 
196 aa  244  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0240677 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1825  50S ribosomal protein L15e  68.88 
 
 
196 aa  236  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1126  Ribosomal protein L15e  61.38 
 
 
199 aa  235  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.032703  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1309  50S ribosomal protein L15e  62.69 
 
 
219 aa  234  6e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2529  50S ribosomal protein L15e  68.75 
 
 
192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0070  50S ribosomal protein L15e  53.63 
 
 
216 aa  186  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000512869  normal  0.0100764 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1799  Ribosomal protein L15e  50 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.171158  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0390  50S ribosomal protein L15e  51.68 
 
 
187 aa  159  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14085  Ribosomal protein L15, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  44.21 
 
 
204 aa  157  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25714  predicted protein  43.18 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329815  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1892  50S ribosomal protein L15e  48.32 
 
 
185 aa  142  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.551367 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1666  50S ribosomal protein L15e  52.85 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0270975 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1254  50S ribosomal protein L15e  48.78 
 
 
154 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0711  50S ribosomal protein L15e  51.22 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177084 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0767  50S ribosomal protein L15e  46.75 
 
 
188 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.599543 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06940  structural constituent of ribosome, putative  40.7 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1751  50S ribosomal protein L15e  49.36 
 
 
190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00445  60S ribosomal protein L15 (Broad)  36.93 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.577151  normal  0.137113 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85750  60S ribosomal protein L15-B (YL10) (L13) (RP15R) (YP18)  38.76 
 
 
204 aa  111  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.162573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>