171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1419 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1419  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  721    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0746849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1733  hypothetical protein  78.06 
 
 
354 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0670  hypothetical protein  72.44 
 
 
354 aa  524  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0679  methanogenesis marker 13 metalloprotein  71.51 
 
 
352 aa  518  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.682238  normal  0.594291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0520  hypothetical protein  68.75 
 
 
353 aa  503  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.268419  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0106  hypothetical protein  57.66 
 
 
369 aa  392  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0346  hypothetical protein  53.46 
 
 
370 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.949651 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1037  hypothetical protein  53.59 
 
 
370 aa  364  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00782668  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1209  vanadium nitrogenase-associated related protein N  40.54 
 
 
366 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1413  vanadium nitrogenase-associated related protein N  38.24 
 
 
366 aa  241  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1313  vanadium nitrogenase-associated related protein N  37.67 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0483  vanadium nitrogenase-associated related protein N  40.49 
 
 
366 aa  237  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0604601  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1425  vanadium nitrogenase-associated related protein N  40.05 
 
 
366 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158785  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1938  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  28.28 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1943  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  33.62 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0682  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.46 
 
 
546 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0741  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.46 
 
 
546 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3093  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  27.27 
 
 
542 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1952  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.84 
 
 
544 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0543638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1355  Nitrogenase  27.94 
 
 
505 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1247  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  36.46 
 
 
544 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0023858  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  33.64 
 
 
511 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1615  oxidoreductase/nitrogenase component 1  39.77 
 
 
448 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1754  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  34.74 
 
 
540 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2274  nitrogenase associated protein E  27.69 
 
 
509 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.204105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0773  nitrogenase  30.51 
 
 
487 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1531  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  34.38 
 
 
546 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1630  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  33.68 
 
 
542 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000671543  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1052  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  37.25 
 
 
452 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0837  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  34.48 
 
 
546 aa  53.9  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1998  nitrogenase  32.61 
 
 
512 aa  53.9  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.33 
 
 
544 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  28.44 
 
 
509 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  30.25 
 
 
459 aa  53.1  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1026  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.77 
 
 
545 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1155  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  29.57 
 
 
539 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4051  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  31.03 
 
 
456 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0313  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  29.91 
 
 
450 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000260706  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1016  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  30.33 
 
 
551 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.29 
 
 
512 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4796  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.69 
 
 
462 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.933705  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1350  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  31.43 
 
 
455 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2818  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.83 
 
 
539 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.365321  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2082  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  29.01 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.94 
 
 
511 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1501  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  34.75 
 
 
466 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01450  Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  34.75 
 
 
475 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  30.43 
 
 
917 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.92 
 
 
520 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3932  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  32.73 
 
 
480 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.844513  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.35 
 
 
458 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  32.29 
 
 
475 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  32.29 
 
 
475 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  31.52 
 
 
425 aa  50.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02610  vanadium nitrogenase, alpha subunit, vnfD  23.93 
 
 
474 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4026  nitrogenase vanadium-iron protein, alpha chain  30.11 
 
 
587 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2009  nitrogenase  28.7 
 
 
516 aa  49.7  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2117  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  30.93 
 
 
467 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0140649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  34.72 
 
 
470 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.615494  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4251  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  28.87 
 
 
905 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0235  oxidoreductase/nitrogenase component 1  34.82 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.317419  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4460  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  31.36 
 
 
556 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1076  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  31.36 
 
 
488 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.57688  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1788  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  34.72 
 
 
470 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.77 
 
 
487 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.96 
 
 
489 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.13 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0507  oxidoreductase/nitrogenase component 1  30.3 
 
 
467 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  27.68 
 
 
456 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4485  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  31.9 
 
 
456 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.33 
 
 
513 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.16 
 
 
487 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.16 
 
 
487 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.61 
 
 
513 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2081  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  30.39 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02770  nitrogenase vanadium iron cofactor biosynthesis protein vnfE  34.95 
 
 
469 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.61 
 
 
512 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.47 
 
 
518 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  22.6 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.49 
 
 
519 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  26.47 
 
 
459 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  25.18 
 
 
511 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.85 
 
 
518 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0972  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  32.2 
 
 
488 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  27.84 
 
 
519 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  31.87 
 
 
489 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  31.82 
 
 
477 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.16 
 
 
489 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5098  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE  30.51 
 
 
487 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0103  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  33.33 
 
 
480 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.21101  normal  0.23619 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  29.59 
 
 
511 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.93 
 
 
511 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.93 
 
 
511 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  19.51 
 
 
458 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  28.33 
 
 
510 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  23.6 
 
 
512 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  25.38 
 
 
489 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  30.93 
 
 
511 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  27.27 
 
 
523 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  30.3 
 
 
515 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>