15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1362 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1362  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  969    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.431827  normal  0.206407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  30.68 
 
 		 883 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  36.47 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  32.53 
 
 		 524 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  36.17 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 		 1251 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  31.31 
 
 		 477 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  27.16 
 
 		 715 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  32.1 
 
 		 589 aa  44.3  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23280  predicted transcriptional regulator  39.19 
 
 		 242 aa  44.3  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  30.68 
 
 		 449 aa  44.3  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 535 aa  43.5  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 821 aa  43.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>