22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1131 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1131  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 129 aa  259  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0618637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0917  transcriptional regulator, TrmB  83.06 
 
 		 124 aa  210  5.999999999999999e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000063679  hitchhiker  0.000000000488515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0584  transcriptional regulator, TrmB  63.41 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000212991  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1387  transcriptional regulator, TrmB  63.41 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1859  hypothetical protein  51.22 
 
 		 124 aa  129  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0870058  normal  0.527414 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0889  transcriptional regulator, TrmB  50.89 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119653  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0982  hypothetical protein  43.8 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0388  hypothetical protein  42.15 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0404  hypothetical protein  43.33 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.000000000144174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0575  hypothetical protein  41.8 
 
 		 129 aa  99.4  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3549  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000882166  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3027  hypothetical protein  40.83 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00669531  normal  0.374075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0497  hypothetical protein  38.71 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.057831  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0588  hypothetical protein  41.07 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.490183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0547  transcriptional regulator, TrmB  44.79 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0378  hypothetical protein  38.05 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000129839  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2262  hypothetical protein  43.36 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0777  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.572189  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2849  hypothetical protein  38.52 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0489802  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1686  hypothetical protein  36.75 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1949  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1951  hypothetical protein  38.94 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>