24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1951 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1951  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  264  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1949  hypothetical protein  68.03 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2262  hypothetical protein  60.34 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2849  hypothetical protein  42.28 
 
 		 129 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0489802  hitchhiker  0.00628176 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0388  hypothetical protein  46.43 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3549  hypothetical protein  44.72 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000882166  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0982  hypothetical protein  47.41 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3027  hypothetical protein  43.9 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00669531  normal  0.374075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1686  hypothetical protein  43.64 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0378  hypothetical protein  44.55 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000129839  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0547  transcriptional regulator, TrmB  44.83 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0404  hypothetical protein  39.32 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  unclonable  0.000000000144174  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1387  transcriptional regulator, TrmB  43.93 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0889  transcriptional regulator, TrmB  44.95 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.119653  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0584  transcriptional regulator, TrmB  41.44 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000212991  normal  0.151075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0917  transcriptional regulator, TrmB  39.83 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000063679  hitchhiker  0.000000000488515 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1131  transcriptional regulator, TrmB  38.94 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0618637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0777  hypothetical protein  34.86 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.572189  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0588  hypothetical protein  33.04 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.490183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0497  hypothetical protein  30.51 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.057831  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0575  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1859  hypothetical protein  38.71 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0870058  normal  0.527414 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>