33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1947 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8835  hypothetical protein  59.38 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0348262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  50.85 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  50.85 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  50.85 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0399  ferredoxin reductase  60 
 
 		 71 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  55 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  47.95 
 
 		 71 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  46.67 
 
 		 70 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  51.67 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  51.67 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  43.33 
 
 		 62 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  51.67 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  53.45 
 
 		 63 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1103  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  44.26 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  43.55 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  45.9 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  40 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  41.94 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  41.94 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  41.94 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  39.34 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  41.67 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  37.1 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7069  putative ferredoxin  37.1 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  38.33 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  36.67 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  37.7 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>