58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0289 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  100 
 
 
246 aa  490  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  40.76 
 
 
215 aa  145  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  34.92 
 
 
193 aa  115  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  28.28 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.26 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1756  protein of unknown function DUF95 transmembrane  42.99 
 
 
197 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  27.91 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1854  protein of unknown function DUF95 transmembrane  36.29 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.52 
 
 
211 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  34.68 
 
 
331 aa  65.1  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2043  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0144  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.28 
 
 
329 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_996  hypothetical protein  30.34 
 
 
185 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1213  hypothetical protein  27.12 
 
 
185 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00201716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1023  hypothetical protein  29.74 
 
 
198 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  34.92 
 
 
331 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  34.15 
 
 
331 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  34.62 
 
 
330 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  34.96 
 
 
330 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  29.41 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  34.29 
 
 
528 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  33.06 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 
754 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.87 
 
 
509 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  29.37 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0527  hypothetical protein  27.52 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.917829  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  29.41 
 
 
337 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  30.65 
 
 
336 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.78 
 
 
318 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  27.89 
 
 
321 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.52 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  27.08 
 
 
603 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0209  hypothetical protein  28.91 
 
 
176 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0691804  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  34.4 
 
 
511 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.95 
 
 
328 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1813  hypothetical protein  29.53 
 
 
196 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.47 
 
 
315 aa  48.9  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  31.38 
 
 
330 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  39.51 
 
 
342 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0535  hypothetical protein  32.95 
 
 
160 aa  45.8  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  29.69 
 
 
328 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.33 
 
 
329 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  39.76 
 
 
330 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  39.76 
 
 
330 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  39.76 
 
 
330 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1074  hypothetical protein  29.47 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1095  hypothetical protein  28.95 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.37 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0796  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.84 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.569051  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.6 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.56 
 
 
335 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  29.27 
 
 
331 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0532  hypothetical protein  28.28 
 
 
188 aa  43.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1285  hypothetical protein  27.94 
 
 
482 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.2 
 
 
333 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  34.57 
 
 
356 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  36.25 
 
 
335 aa  42  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>