33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1401 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  100 
 
 		 155 aa  313  6e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  72.31 
 
 		 135 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  70.77 
 
 		 135 aa  206  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  70 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  65.38 
 
 		 135 aa  181  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  51.26 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  45.38 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  43.7 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  40.16 
 
 		 335 aa  104  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  38.76 
 
 		 197 aa  103  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  40.34 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  41.74 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  42.11 
 
 		 236 aa  101  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  38.52 
 
 		 240 aa  100  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  42.37 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  38.6 
 
 		 236 aa  97.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  40.54 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  39.13 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  41.18 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  38.18 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  43.4 
 
 		 240 aa  92.8  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  40.34 
 
 		 149 aa  91.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  40.54 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  34.78 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  38.71 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  34.01 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  36.51 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  35.29 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  36.36 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  33.06 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  35 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  27.68 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>