17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2698 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2698  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2330  hypothetical protein  48.28 
 
 		 92 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0849  putative ATP synthase protein I  59.76 
 
 		 90 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3051  F0F1-ATPase subunit, putative  34.69 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3104  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  32.99 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.496564  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0950  F0F1-ATPase subunit  36.26 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0546463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1956  F0F1-ATPase subunit, putative  35.48 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1659  F0F1-ATPase subunit, putative  50.79 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1055  F0F1-ATPase subunit  33.67 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0465  F0F1-ATPase subunit, putative  32.26 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0890  F0F1-ATPase subunit  32.05 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.349034  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0437  ATP synthase F0F1, subunit  37.8 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.150383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1127  F0F1-ATPase subunit  38.03 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0047  putative ATP synthesis-related protein  30.34 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0553479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1065  F0F1-ATPase subunit, putative  36.71 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2991  ATP synthase gene 1  35.9 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19690  H(+)-transporting ATP synthase, gene 1  31.25 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>