More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf438 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf438  50S ribosomal protein L22  100 
 
 
210 aa  412  1e-114  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  61.62 
 
 
111 aa  122  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  59.05 
 
 
112 aa  120  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  50 
 
 
118 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0720  ribosomal protein L22  56.57 
 
 
110 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 
114 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  53.7 
 
 
114 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  53.27 
 
 
110 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  53.77 
 
 
110 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  58.59 
 
 
113 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  54.63 
 
 
117 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 
110 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 
115 aa  107  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  56.57 
 
 
113 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  51.89 
 
 
110 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  52.83 
 
 
110 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  53.27 
 
 
136 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
117 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
117 aa  105  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
117 aa  104  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  52.38 
 
 
113 aa  104  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  52.78 
 
 
111 aa  104  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  52.25 
 
 
136 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
113 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  50.47 
 
 
110 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  50.51 
 
 
110 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1569  ribosomal protein L22  49.06 
 
 
115 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00016664  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  50.93 
 
 
118 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
113 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
113 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
113 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
113 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
113 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
113 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  49.53 
 
 
139 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0300  ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
113 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  41.56 
 
 
158 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
113 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
113 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  52.34 
 
 
110 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  52.34 
 
 
110 aa  102  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1849  50S ribosomal protein L22  47.62 
 
 
115 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000192046  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0342  50S ribosomal protein L22  47.62 
 
 
115 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000162922  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
110 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  50.48 
 
 
111 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  55.14 
 
 
113 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  49.52 
 
 
110 aa  101  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  48.28 
 
 
115 aa  101  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0785  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 
149 aa  101  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.363431  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
111 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 
111 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  52.88 
 
 
127 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  50.94 
 
 
110 aa  100  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 
114 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2367  ribosomal protein L22  51.52 
 
 
110 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.414165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  50.51 
 
 
113 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  47.62 
 
 
110 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  48.62 
 
 
120 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  53.54 
 
 
111 aa  99  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  47.66 
 
 
119 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  53.27 
 
 
125 aa  98.6  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  52.53 
 
 
112 aa  98.2  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  48.08 
 
 
111 aa  98.2  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  49.04 
 
 
111 aa  98.6  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 
109 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  51.43 
 
 
109 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
152 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  46.49 
 
 
122 aa  97.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
152 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  52.48 
 
 
159 aa  97.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  45.54 
 
 
158 aa  97.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  47.62 
 
 
133 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  45.37 
 
 
113 aa  97.4  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2164  ribosomal protein L22  49.06 
 
 
112 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.135391 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  51.49 
 
 
159 aa  97.1  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0724  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000976773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0399  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
111 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0374  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
111 aa  96.3  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  49.53 
 
 
113 aa  95.9  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>