28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00248 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00248  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0481  hypothetical protein  32.11 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0505  hypothetical protein  32.11 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3838  hypothetical protein  32.11 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0502  hypothetical protein  32.11 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0750  fimbrial assembly family protein  27.54 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0167  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4420  fimbrial assembly family protein  26.32 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3489  hypothetical protein  28.88 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3666  fimbrial assembly family protein  28.42 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0463  hypothetical protein  28.65 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3771  fimbrial assembly family protein  28.57 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0451  hypothetical protein  26.88 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0557  hypothetical protein  27.17 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0541  fimbrial assembly family protein  27.03 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002365  MSHA biogenesis protein MshI  27.27 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3350  hypothetical protein  28.43 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0386  fimbrial assembly family protein  28.68 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03701  hypothetical protein  25.38 
 
 		 482 aa  58.5  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3277  MshA biogenesis protein MshI-2  22.71 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  21.74 
 
 		 479 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3754  hypothetical protein  34.72 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0890  hypothetical protein  21.47 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0466  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHI)  21.57 
 
 		 487 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0327432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0382  MshA biogenesis protein MshI-2  28.45 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3335  fimbrial assembly  25.13 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0761  hypothetical protein  22.11 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0217944  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  23.68 
 
 		 553 aa  42.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>