28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6846 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6846  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  800    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7582  hypothetical protein  78.04 
 
 		 409 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117835  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5639  putative CheA signal transduction histidine kinase  53.63 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  0.277349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0941  hypothetical protein  49.16 
 
 		 493 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1006  hypothetical protein  35.25 
 
 		 634 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0103184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4085  hypothetical protein  36.21 
 
 		 553 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.414268  normal  0.0981997 
 
 
-
 
NC_004310  BR1681  hypothetical protein  28.9 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571535  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1625  hypothetical protein  28.9 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4773  hypothetical protein  35.93 
 
 		 534 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43696  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1232  hypothetical protein  28.75 
 
 		 479 aa  141  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2964  hypothetical protein  40.31 
 
 		 540 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.209259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3157  hypothetical protein  37.26 
 
 		 544 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0907045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1124  hypothetical protein  39.34 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1851  hypothetical protein  41.57 
 
 		 546 aa  136  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1331  hypothetical protein  40.58 
 
 		 540 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3893  hypothetical protein  41.34 
 
 		 541 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0724599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  42.53 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 766 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3345  hypothetical protein  34.46 
 
 		 841 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172568  decreased coverage  0.00479246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3542  hypothetical protein  32.37 
 
 		 715 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652953  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3088  hypothetical protein  32.77 
 
 		 836 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671976  normal  0.139652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0963  hypothetical protein  75.71 
 
 		 493 aa  106  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.373348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1000  hypothetical protein  75.71 
 
 		 492 aa  106  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1763 aa  99.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1680 aa  97.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0286  hypothetical protein  20.82 
 
 		 499 aa  92.4  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0036  hypothetical protein  50 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  46.88 
 
 		 277 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>