46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6153 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6153  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0074  hypothetical protein  61.22 
 
 		 244 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2224  hypothetical protein  58.74 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2005  hypothetical protein  60.24 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.878418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  56.85 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3504  hypothetical protein  54.07 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.705316  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2236  prolyl oligopeptidase family protein  54.07 
 
 		 270 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.99651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3437  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  52.85 
 
 		 256 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3136  hypothetical protein  57.38 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  54.55 
 
 		 276 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1859  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  53.25 
 
 		 256 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2291  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  54.22 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155063  hitchhiker  0.0000115938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5039  hypothetical protein  56.68 
 
 		 252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00504479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36540  hypothetical protein  54.72 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232099  normal  0.968112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4571  PGAP1 family protein  57.2 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.28491 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4297  prolyl oligopeptidase family protein  52.7 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5051  PGAP1 family protein  54.85 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3196  PGAP1 family protein  54.85 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  25.19 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  27.37 
 
 		 490 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  30.13 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  33.6 
 
 		 868 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  29.31 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  25.12 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  22.69 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  31.25 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  32.46 
 
 		 317 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  27 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  32.56 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  28.68 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.51 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  34.88 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  34.88 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  31.25 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  31.4 
 
 		 317 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  28.95 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.47 
 
 		 677 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330488  normal  0.102589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1753  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  33 
 
 		 453 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45323  normal  0.582336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3599  hypothetical protein  25.11 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0996  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.76 
 
 		 771 aa  42.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  31.4 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  30.23 
 
 		 341 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  28.91 
 
 		 656 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  30.23 
 
 		 342 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  24.91 
 
 		 496 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  26.89 
 
 		 292 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>