40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3698 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0261  chlorophyllide reductase, BchY subunit  73.32 
 
 		 502 aa  668    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1711  chlorophyllide reductase subunit Y  74.84 
 
 		 528 aa  711    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2853  chlorophyllide reductase subunit Y  75.96 
 
 		 508 aa  745    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.922563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3698  chlorophyllide reductase subunit Y  100 
 
 		 516 aa  1014    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465391  hitchhiker  0.00482074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2817  chlorophyllide reductase subunit Y  78.19 
 
 		 509 aa  761    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0774355  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2053  chlorophyllide reductase subunit Y  75.26 
 
 		 513 aa  712    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0326514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2731  chlorophyllide reductase subunit Y  77.04 
 
 		 508 aa  746    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3518  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Y  72.18 
 
 		 534 aa  716    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.292352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6436  bacteriochlorophyllide reductase subunit  77.35 
 
 		 512 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2958  chlorophyllide reductase subunit Y  77.24 
 
 		 508 aa  744    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  70.97 
 
 		 500 aa  653    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201918  normal  0.260715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1905  chlorophyllide reductase subunit Y  72.69 
 
 		 502 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2979  chlorophyllide reductase subunit Y  76.55 
 
 		 468 aa  675    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.927182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4000  chlorophyllide reductase subunit Y  75.48 
 
 		 533 aa  710    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.130756  hitchhiker  0.00873228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3755  chlorophyllide reductase subunit Y  74.62 
 
 		 540 aa  707    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1294  chlorophyllide reductase subunit Y  74.2 
 
 		 535 aa  715    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0178  chlorophyllide reductase subunit Y  72.16 
 
 		 521 aa  685    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1609  chlorophyllide reductase subunit Y  70.78 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3744  chlorophyllide reductase subunit Y  39.32 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000125918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0324  chlorophyllide reductase subunit Y  34.78 
 
 		 412 aa  270  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3257  chlorophyllide reductase subunit Y  39.56 
 
 		 422 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212884 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2411  chlorophyllide reductase subunit Y  35.59 
 
 		 411 aa  269  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2035  chlorophyllide reductase subunit Y  36.32 
 
 		 412 aa  266  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0342  chlorophyllide reductase subunit Y  35.65 
 
 		 418 aa  266  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.680799  normal  0.193791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0850  chlorophyllide reductase subunit Y  39.43 
 
 		 438 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.053677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2062  chlorophyllide reductase subunit Y  34.03 
 
 		 422 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.730736  normal  0.0621767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2075  chlorophyllide reductase subunit Y  35.04 
 
 		 412 aa  259  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.027568  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1863  chlorophyllide reductase subunit Y  33.73 
 
 		 415 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07951  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  24.73 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1910  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.34 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.902944  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1848  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  29.59 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5283  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  30.5 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1619  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  25.81 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.43602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  23.83 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4816  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  30 
 
 		 422 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  0.0186172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6417  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  26.9 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.577987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1637  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  27.34 
 
 		 424 aa  44.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1530  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  21.63 
 
 		 465 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0215  light-independent protochlorophyllide reductase subunit N  22.16 
 
 		 420 aa  43.9  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  22.92 
 
 		 460 aa  43.5  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>