More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0037 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  80.44 
 
 		 430 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  77.72 
 
 		 424 aa  700    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  86.15 
 
 		 428 aa  774    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  87.26 
 
 		 432 aa  785    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  84.21 
 
 		 427 aa  761    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  80.68 
 
 		 430 aa  716    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  87.5 
 
 		 432 aa  788    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  76.53 
 
 		 427 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  76.34 
 
 		 435 aa  687    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  94.9 
 
 		 431 aa  860    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  72.22 
 
 		 430 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  76.77 
 
 		 426 aa  690    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  80.93 
 
 		 421 aa  721    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  77.51 
 
 		 429 aa  699    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  100 
 
 		 431 aa  894    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  80.93 
 
 		 430 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  88.44 
 
 		 432 aa  794    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  64.32 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  91.98 
 
 		 392 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  48.35 
 
 		 418 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  43.93 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  43.08 
 
 		 401 aa  316  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  41.28 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  39.9 
 
 		 464 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  41.65 
 
 		 443 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  38.66 
 
 		 449 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  39.95 
 
 		 468 aa  275  8e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  39.65 
 
 		 445 aa  275  9e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  39.33 
 
 		 450 aa  272  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  39.59 
 
 		 451 aa  272  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  39.4 
 
 		 451 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  40.05 
 
 		 449 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  39.69 
 
 		 455 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  39.8 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  40.79 
 
 		 441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  36.86 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  36.97 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  36.58 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  35.39 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  38.24 
 
 		 451 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3394  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 1823 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.67 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3202  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 1912 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213364 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 361 aa  137  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 		 358 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2930  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 1912 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0842557 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.86 
 
 		 346 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.17 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.16 
 
 		 342 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.79 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 342 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 337 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 342 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.79 
 
 		 341 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 339 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.41 
 
 		 340 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3067  alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0849816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2086  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 		 340 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.32 
 
 		 359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  30.92 
 
 		 339 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.47 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 344 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  27.08 
 
 		 340 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3807  alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 		 331 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2518  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  26.88 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647775  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  26.78 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  26.55 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1997  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.65 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1862  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.85 
 
 		 340 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159614  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  26.53 
 
 		 360 aa  99.8  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2490  alcohol dehydrogenase  24.66 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0275414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2677  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.84 
 
 		 329 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.231466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.53 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03873  zinc-containing alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08240)  29.34 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4459  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.46 
 
 		 338 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3273  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  24.51 
 
 		 332 aa  97.1  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.25 
 
 		 342 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0417  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.92 
 
 		 323 aa  96.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 		 339 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.19 
 
 		 342 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.48 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  26.24 
 
 		 342 aa  95.5  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2893  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.342375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1402  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.97 
 
 		 352 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.126612  normal  0.52668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  25.96 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0618  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.67 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00991906  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2636  alcohol dehydrogenase  23.1 
 
 		 329 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114125 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3221  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  23.94 
 
 		 332 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.5 
 
 		 341 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2675  alcohol dehydrogenase  23.64 
 
 		 329 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3522  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  23.66 
 
 		 332 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.27 
 
 		 331 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0607  alcohol dehydrogenase  25.77 
 
 		 328 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>