17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0015 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0015  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 346 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349617  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3760  Phytanoyl-CoA dioxygenase  80 
 
 		 346 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8687  Phytanoyl-CoA dioxygenase  79.42 
 
 		 346 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1911  phytanoyl-CoA dioxygenase  79.75 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3963  phytanoyl-CoA dioxygenase  50 
 
 		 341 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0322  phytanoyl-CoA dioxygenase  48.24 
 
 		 355 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1940  phytanoyl-CoA dioxygenase  47.48 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8686  phytanoyl-CoA dioxygenase  46.76 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8688  Phytanoyl-CoA dioxygenase  48.99 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6410  Phytanoyl-CoA dioxygenase  48.99 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1839  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.4 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3918  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.96 
 
 		 347 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5428  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.28 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0395279 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1510  hypothetical protein  32.43 
 
 		 317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0888  hypothetical protein  31.51 
 
 		 300 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.475505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4572  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.13 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2399  hypothetical protein  40.74 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.127466  normal  0.479331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>