More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1327 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  51.69 
 
 		 810 aa  658    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.86 
 
 		 811 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  50.76 
 
 		 824 aa  646    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  51.02 
 
 		 817 aa  655    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.71 
 
 		 811 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  51.55 
 
 		 823 aa  657    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0488  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  61.16 
 
 		 753 aa  930    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00725796  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  50.46 
 
 		 830 aa  650    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  50.38 
 
 		 852 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.71 
 
 		 811 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  49.71 
 
 		 811 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  49.71 
 
 		 811 aa  645    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  48.98 
 
 		 812 aa  660    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  49.13 
 
 		 810 aa  654    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  48.4 
 
 		 823 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  50.69 
 
 		 814 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  50.24 
 
 		 812 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  50.78 
 
 		 855 aa  635    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  48.96 
 
 		 846 aa  635    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  51.73 
 
 		 829 aa  659    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2116  ATPase AAA-2 domain protein  45.91 
 
 		 781 aa  657    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284503  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.71 
 
 		 811 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0889  ATPase AAA-2 domain protein  58.4 
 
 		 725 aa  837    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000179007  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  48.54 
 
 		 842 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.46 
 
 		 840 aa  650    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  49.77 
 
 		 824 aa  637    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  47.97 
 
 		 841 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  51.69 
 
 		 847 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0045  ATPase  49.16 
 
 		 745 aa  636    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  51.45 
 
 		 837 aa  638    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  48.42 
 
 		 819 aa  658    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  53.06 
 
 		 837 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  48.81 
 
 		 811 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  51.45 
 
 		 835 aa  643    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  50.08 
 
 		 825 aa  654    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  49.77 
 
 		 825 aa  638    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  53.7 
 
 		 816 aa  649    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  51.69 
 
 		 812 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  51.72 
 
 		 818 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.71 
 
 		 811 aa  644    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0578  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  63.8 
 
 		 748 aa  950    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0804  ATPase AAA-2 domain protein  55.83 
 
 		 676 aa  731    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  51.31 
 
 		 814 aa  656    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  67.88 
 
 		 726 aa  886    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  51.45 
 
 		 834 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1363  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  65.75 
 
 		 722 aa  930    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000152049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  50.85 
 
 		 866 aa  636    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  49.37 
 
 		 810 aa  662    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0571  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  63.76 
 
 		 684 aa  891    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0648  ATP-dependent Clp protease  61.2 
 
 		 752 aa  920    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  49.7 
 
 		 830 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  52.41 
 
 		 850 aa  651    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  49.7 
 
 		 839 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  51.72 
 
 		 818 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  50 
 
 		 825 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1763  ATPase AAA-2 domain protein  58.18 
 
 		 712 aa  837    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  49.77 
 
 		 848 aa  644    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2678  ATPase  52.29 
 
 		 840 aa  641    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  51.69 
 
 		 847 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1327  ATPase  100 
 
 		 734 aa  1505    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00363395  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  49.5 
 
 		 811 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  49.35 
 
 		 811 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.64 
 
 		 811 aa  647    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  49.17 
 
 		 842 aa  640    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  49.71 
 
 		 811 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  49.78 
 
 		 812 aa  643    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0312  ATPase AAA-2  48.68 
 
 		 803 aa  671    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  51.52 
 
 		 818 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0559  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  49.77 
 
 		 870 aa  632  1e-180  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  49.16 
 
 		 812 aa  634  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  48.09 
 
 		 821 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1000  ATPase AAA-2 domain-containing protein  50.77 
 
 		 815 aa  632  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0499037  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  50.96 
 
 		 841 aa  634  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  52.05 
 
 		 851 aa  632  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0572  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  49.85 
 
 		 720 aa  632  1e-180  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.544147  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  49.77 
 
 		 869 aa  632  1e-180  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  50.39 
 
 		 854 aa  632  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  49.35 
 
 		 826 aa  633  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  52.66 
 
 		 834 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  49.4 
 
 		 822 aa  631  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  51.01 
 
 		 858 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  52.66 
 
 		 814 aa  629  1e-179  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  50.31 
 
 		 789 aa  629  1e-179  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  52.66 
 
 		 834 aa  630  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  50.88 
 
 		 842 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  50.47 
 
 		 840 aa  630  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1489  ATPase AAA-2 domain protein  51.21 
 
 		 813 aa  629  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  49.4 
 
 		 822 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  47.94 
 
 		 834 aa  631  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  50.64 
 
 		 846 aa  631  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1682  ATPase AAA-2 domain protein  50.87 
 
 		 868 aa  630  1e-179  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  48.71 
 
 		 812 aa  629  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  49.38 
 
 		 829 aa  629  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  48.15 
 
 		 843 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  49.62 
 
 		 822 aa  628  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  47.95 
 
 		 830 aa  627  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  49.62 
 
 		 879 aa  627  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  51.13 
 
 		 860 aa  627  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  48.6 
 
 		 830 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  50.24 
 
 		 852 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>