22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1051 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 		 672 aa  1330    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  25.88 
 
 		 728 aa  89  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  26.07 
 
 		 315 aa  88.2  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  24.76 
 
 		 706 aa  88.2  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  25 
 
 		 978 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  23.62 
 
 		 749 aa  80.9  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  25.76 
 
 		 715 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  26.1 
 
 		 945 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  24.8 
 
 		 736 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  24.52 
 
 		 884 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  22.26 
 
 		 784 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  23.98 
 
 		 997 aa  62  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  17.95 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  26.22 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  24.15 
 
 		 976 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  21.27 
 
 		 862 aa  53.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  23.53 
 
 		 577 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  22.09 
 
 		 735 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3419  KAP P-loop  24.28 
 
 		 394 aa  45.8  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  23.04 
 
 		 758 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  29.03 
 
 		 546 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  32.35 
 
 		 585 aa  44.3  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>