238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0906 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0906  LrgB family protein  100 
 
 		 246 aa  481  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0185  hypothetical protein  56.36 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5232  antiholin-like protein LrgB  46.09 
 
 		 230 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5571  antiholin-like protein LrgB  46.09 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5619  antiholin-like protein LrgB  46.09 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5293  antiholin-like protein LrgB  46.09 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5120  antiholin-like protein LrgB  46.09 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5135  antiholin-like protein LrgB  46.09 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0238416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5689  antiholin-like protein LrgB  46.09 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5563  antiholin-like protein LrgB  46.09 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5534  antiholin-like protein LrgB  46.09 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5386  antiholin-like protein LrgB  46.09 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  0.703231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3956  antiholin-like protein LrgB  44.64 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2027  antiholin-like protein LrgB  42.55 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.69711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0248  antiholin-like protein LrgB  41.52 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0254  antiholin-like protein LrgB  41.52 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3199  hypothetical protein  30.49 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.180228  normal  0.0164124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  32.26 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  28.57 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1948  lrgB-like family protein  27.63 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2236  lrgB-like family protein  27.85 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1949  LrgB family protein  29.82 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0707  LrgB family protein  30.45 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000904549  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0811  putative effector of murein hydrolase  28.86 
 
 		 232 aa  102  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00607912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0128  LrgB family protein  29.17 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  28.99 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  28.99 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  28.45 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  28.15 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  30.23 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1938  LrgB-like protein  27.08 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0159  LrgB family protein  29.44 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  30.23 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  30.23 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  30.23 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  30.23 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  30.23 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  30.23 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  27.73 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  30.23 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  30.23 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  29.21 
 
 		 231 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  28.78 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  28.43 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  28.43 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  28.43 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  28.43 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0623  LrgB-like protein  31.32 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  28.43 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  28.43 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  28.43 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3768  LrgB family protein  26.94 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  31.52 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1359  LrgB family protein  30.99 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957145  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  28.49 
 
 		 225 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  30.91 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2977  LrgB family protein  26.84 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3735  LrgB family protein  32.37 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  30.86 
 
 		 235 aa  89.4  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  31.48 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1161  LrgB family protein  28.21 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2328  hypothetical protein  28.22 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2372  hypothetical protein  28.22 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2417  hypothetical protein  28.22 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2421  hypothetical protein  28.22 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00860  putative effector of murein hydrolase  25.42 
 
 		 234 aa  88.6  9e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  27.97 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  30.86 
 
 		 235 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2405  LrgB family protein  26.84 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  27.51 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1569  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2560  hypothetical protein  29.91 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3106  LrgB-like protein  27.98 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2795  LrgB-like protein  26.61 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  30.68 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  31.25 
 
 		 224 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2529  hypothetical protein  27.72 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  28.49 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  28.49 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  28.49 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  28.49 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  28.49 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  28.49 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  28.15 
 
 		 246 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  28.49 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  30.06 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2461  hypothetical protein  29.44 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3024  hypothetical protein  29.44 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318383  normal  0.0470923 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  28.49 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5246  hypothetical protein  28.49 
 
 		 195 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  30.81 
 
 		 224 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  28.49 
 
 		 230 aa  85.1  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1497  hypothetical protein  29.9 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2116  hypothetical protein  28.18 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0001189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1577  LrgB family protein  27.91 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.4351e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  28.8 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1236  hypothetical protein  27.69 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  28.8 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3388  LrgB family protein  26.75 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3524  LrgB family protein  25.86 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>