More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3833 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3833  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  608  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3385  transport protein  75.17 
 
 		 306 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.428811 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1271  CBS domain-containing protein  65.08 
 
 		 307 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4209  CBS domain-containing protein  64.24 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0439  CBS domain-containing protein  63.96 
 
 		 289 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3698  CBS  62.67 
 
 		 288 aa  358  6e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4763  CBS domain containing protein  63.09 
 
 		 292 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4185  CBS domain-containing protein  59.6 
 
 		 294 aa  348  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718893 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0523  CBS domain-containing protein  58.33 
 
 		 306 aa  348  6e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0257168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0539  CBS domain containing protein  58.39 
 
 		 292 aa  346  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2157  CBS domain-containing protein  60.34 
 
 		 291 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  49.82 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  48.8 
 
 		 311 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  50.36 
 
 		 311 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.93 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.59 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.59 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  48.76 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.59 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.59 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  49.15 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.59 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.59 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  47.42 
 
 		 403 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  48.97 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  48.06 
 
 		 295 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  48.06 
 
 		 295 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  48.06 
 
 		 295 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  48.62 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  47.7 
 
 		 295 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  48.18 
 
 		 295 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  48.18 
 
 		 295 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  48.59 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  47.74 
 
 		 293 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  48.08 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  46.77 
 
 		 278 aa  232  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  42.01 
 
 		 282 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  45 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  41.7 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0648  CBS  43.17 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  43.87 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  43.4 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  43.19 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  45.04 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  41.49 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  40.29 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  42.02 
 
 		 291 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  42.7 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  40.59 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  40.29 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.98 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  40.59 
 
 		 279 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  40.22 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  40.22 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  40.22 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  40.56 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  38.91 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  42.8 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  40.66 
 
 		 279 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.61 
 
 		 284 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  39.86 
 
 		 279 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  39.3 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  43.01 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  43.01 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.89 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00451  polar amino acid transporter  42.55 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0391689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  39.3 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  40.47 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  40.47 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  40.47 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  41.03 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  40.66 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  40.47 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  38.49 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 		 291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  39.3 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  40.15 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  39.78 
 
 		 323 aa  189  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.3 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  39.48 
 
 		 280 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  39.48 
 
 		 280 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  37.93 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  40.56 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0532  Mg2+/Co2+ transporter  38.31 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174444  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  34.98 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3575  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.73 
 
 		 292 aa  178  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  41.79 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  38.55 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  41.57 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  34.63 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  38.26 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1216  transporter-associated region  40.61 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.14368  normal  0.614507 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01227  hypothetical protein  36.84 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1184  CBS domain-containing protein  41 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1833  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.92 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2918  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.92 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3008  transporter-associated region  36.92 
 
 		 292 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.983177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0821  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.85 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>