48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0111 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  100 
 
 		 253 aa  491  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  36.4 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  42.45 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0459  YibE/F family protein  42.68 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  33.07 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0867  hypothetical protein  31.33 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  31.67 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  31.67 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  29.22 
 
 		 404 aa  82  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  27.89 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  24.8 
 
 		 393 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  28.29 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  26.27 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  25.85 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  25.83 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  30.09 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  25 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  28.15 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  26.64 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  27.87 
 
 		 416 aa  59.3  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  27.4 
 
 		 448 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  26.92 
 
 		 449 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  26.67 
 
 		 484 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  25.51 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  25.11 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  27.53 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  25.51 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  27.41 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  27.41 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  25.13 
 
 		 499 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  25 
 
 		 404 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  24.11 
 
 		 484 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  24.61 
 
 		 406 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  28.97 
 
 		 386 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  24.34 
 
 		 513 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  27.45 
 
 		 396 aa  48.5  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  24.39 
 
 		 427 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  31.15 
 
 		 372 aa  47.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  23.89 
 
 		 599 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  26.96 
 
 		 446 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  22.64 
 
 		 422 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  29.75 
 
 		 371 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  25.45 
 
 		 345 aa  45.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  21.31 
 
 		 428 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1824  multitransmembrane protein  22.22 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0110  multitransmembrane protein  29.33 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000156468 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  28.95 
 
 		 365 aa  43.5  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>