25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_t0569 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_t0569  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96 
 
 		 88 bp  125  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0039  tRNA-Ser  94.44 
 
 		 88 bp  111  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0043  tRNA-Ser  91.8 
 
 		 94 bp  75.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0056  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000134198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0041  tRNA-Ser  87.5 
 
 		 91 bp  71.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614795  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0032  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0176  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0091  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0055  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0084  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.242329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0043  tRNA-Ser  92.5 
 
 		 93 bp  56  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000118785  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0025  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0026  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019004  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0002  tRNA-Ser  85 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0051  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000993594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0119  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0009  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.509163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0008  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1213  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.645556  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0044  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4302  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0357702  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0011  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>