27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2164 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2164  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  317  3e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.771382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  40.32 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  36.05 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  36.92 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  32.05 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  39.06 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  32.05 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  32.05 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  34.25 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  32.05 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  32.05 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  38.71 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 
92 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  37.84 
 
 
128 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  45.31 
 
 
67 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  33.87 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003812  phage shock protein C  29.31 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  36.76 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  36.76 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  38.36 
 
 
233 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 
66 aa  40.8  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  35.29 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>