35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1330 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1330  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1458  aminoglycoside phosphotransferase  52.23 
 
 		 261 aa  243  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.158557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0369  aminoglycoside phosphotransferase  31.19 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000170406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0973  aminoglycoside 3-phosphotransferase type IIB  29.25 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0966  aminoglycoside phosphotransferase  28.12 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.238435  normal  0.264517 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2256  aminoglycoside phosphotransferase  25.35 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10670  aminoglycoside 3'-phosphotransferase type IIB  31.82 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2197  aminoglycoside phosphotransferase  26.22 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0392528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1320  aminoglycoside phosphotransferase  26.85 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3721  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  24.75 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0195  aminoglycoside phosphotransferase  24.75 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000752934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1717  aminoglycoside phosphotransferase  27.33 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2951  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863477  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6179  aminoglycoside phosphotransferase  24.76 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0454  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  24.1 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5038  Kanamycin kinase  30.2 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0328553 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0010  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  26.39 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.590749  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0159  aminoglycoside 3'-phosphotransferase  25.71 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3531  aminoglycoside phosphotransferase  31.67 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2693  aminoglycoside phosphotransferase  28.17 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.876153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4099  3''-kinase  25.56 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2292  aminoglycoside phosphotransferase  24.58 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168028  normal  0.166014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6646  3''-kinase  30.36 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3941  3''-kinase  30.36 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  hitchhiker  0.00925302 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0128  aminoglycoside resistance protein A  26.32 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1464  aminoglycoside phosphotransferase  24.28 
 
 		 261 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1570  aminoglycoside resistance protein A  26.32 
 
 		 302 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.202479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009789  EcE24377A_B0004  streptomycin resistance protein, StrA  26.32 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13851  phosphotransferase  26.11 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.612969 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0046  streptomycin resistance protein StrA  26.32 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2669  aminoglycoside phosphotransferase  26.32 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0328052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0085  aminoglycoside resistance protein A  26.32 
 
 		 329 aa  46.2  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.735517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1799  aminoglycoside phosphotransferase  23.21 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3368  aminoglycoside phosphotransferase  21.88 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1860  aminoglycoside phosphotransferase  22.83 
 
 		 447 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.257775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>