46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1052 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  100 
 
 		 500 aa  983    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  31.6 
 
 		 534 aa  266  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.14 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  28.88 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  26.21 
 
 		 531 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  27.48 
 
 		 548 aa  150  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  24.53 
 
 		 550 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  23.35 
 
 		 530 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  25.2 
 
 		 529 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  24.34 
 
 		 566 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  28.25 
 
 		 551 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  23.63 
 
 		 526 aa  130  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  25.87 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  23.11 
 
 		 565 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  24.95 
 
 		 652 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  25.11 
 
 		 532 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  25.43 
 
 		 552 aa  115  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  25.39 
 
 		 551 aa  110  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.43 
 
 		 545 aa  107  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  24.39 
 
 		 529 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  24.2 
 
 		 532 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  24.2 
 
 		 532 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  24.2 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  25.7 
 
 		 552 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  25.31 
 
 		 523 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  21.76 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  23.68 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  22.86 
 
 		 561 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  26.55 
 
 		 527 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  22.96 
 
 		 528 aa  96.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  27.73 
 
 		 540 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  24.95 
 
 		 496 aa  94.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  26.34 
 
 		 549 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  23.36 
 
 		 548 aa  94  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  27.04 
 
 		 539 aa  93.6  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  24.69 
 
 		 555 aa  92.8  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  20.53 
 
 		 542 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  24.95 
 
 		 541 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  20.73 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  20.73 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  25.71 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  22.86 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  25.62 
 
 		 527 aa  70.1  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  25.12 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  32.94 
 
 		 143 aa  51.2  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  20.16 
 
 		 546 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>