48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25810 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  100 
 
 		 532 aa  994    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  76.86 
 
 		 528 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  42.18 
 
 		 529 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  44.42 
 
 		 548 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  44.76 
 
 		 561 aa  332  9e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  46.54 
 
 		 529 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  47.27 
 
 		 533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  39.29 
 
 		 566 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  41.23 
 
 		 652 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  39.67 
 
 		 540 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  39.52 
 
 		 539 aa  247  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  35.9 
 
 		 526 aa  229  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  37.81 
 
 		 550 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  37.04 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  35.5 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  34.52 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  35.35 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  31.25 
 
 		 555 aa  193  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  36.26 
 
 		 532 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  35.32 
 
 		 533 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.07 
 
 		 551 aa  181  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  33.39 
 
 		 565 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  34.15 
 
 		 523 aa  179  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  28.33 
 
 		 534 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  36.24 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  39.78 
 
 		 548 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  34 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.48 
 
 		 534 aa  163  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  34.34 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  34.34 
 
 		 532 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  34.34 
 
 		 532 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 551 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  31.77 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  35.75 
 
 		 540 aa  145  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  33.58 
 
 		 555 aa  144  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.33 
 
 		 541 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  38.61 
 
 		 549 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  34.15 
 
 		 544 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  22.16 
 
 		 500 aa  103  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  30.19 
 
 		 496 aa  92.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  24.7 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.42 
 
 		 542 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.42 
 
 		 542 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  27.52 
 
 		 542 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  30.39 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  30.86 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0567  hypothetical protein  41.27 
 
 		 143 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.939774  hitchhiker  0.00416939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  37.76 
 
 		 270 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>