31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4139 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  331  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  55.33 
 
 
154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  51.66 
 
 
155 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  55.24 
 
 
154 aa  156  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  49.66 
 
 
154 aa  153  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  60.87 
 
 
146 aa  144  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  54.61 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  138  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  50.35 
 
 
156 aa  138  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  55.17 
 
 
323 aa  137  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  49.62 
 
 
154 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  47.76 
 
 
156 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  43.57 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  42.14 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  43.48 
 
 
153 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  41.5 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  44.72 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  46.49 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  35.59 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  33.87 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  33.06 
 
 
149 aa  58.2  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5367  hypothetical protein  36.52 
 
 
245 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.66384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  27.78 
 
 
166 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  40.68 
 
 
132 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  32.82 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1353  hypothetical protein  22.64 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  35 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2765  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.183145  hitchhiker  0.00416303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1626  hypothetical protein  32.09 
 
 
117 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.34451  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>