17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0559 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0559  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  844    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.309462  normal  0.837704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1062  membrane protein  38.92 
 
 		 615 aa  260  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3937  membrane protein  34.89 
 
 		 808 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183856  normal  0.16689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0791  O-antigen and teichoic acid-like export protein  36.59 
 
 		 1273 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750231  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3189  hypothetical protein  35.92 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.127447  hitchhiker  0.0000558428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2389  putative integral membrane protein  37.71 
 
 		 454 aa  204  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00613681  normal  0.0209947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0371  hypothetical protein  35.96 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3798  hypothetical protein  23.08 
 
 		 449 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.878935  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02859  predicted inner membrane protein  26.33 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3450  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3268  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.33 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.809539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0710  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3163  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0755  hypothetical protein  27.09 
 
 		 361 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2502  O-antigen and teichoic acid-like export protein  35.85 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1822  hypothetical protein  34.19 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000473849  normal  0.0325575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5602  hypothetical protein  32.61 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>