9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3937 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3937  membrane protein  100 
 
 		 808 aa  1570    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183856  normal  0.16689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0791  O-antigen and teichoic acid-like export protein  50.08 
 
 		 1273 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750231  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1062  membrane protein  51.46 
 
 		 615 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2389  putative integral membrane protein  46.42 
 
 		 454 aa  305  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00613681  normal  0.0209947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0559  hypothetical protein  34.89 
 
 		 443 aa  220  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.309462  normal  0.837704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3189  hypothetical protein  36.11 
 
 		 428 aa  213  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.127447  hitchhiker  0.0000558428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0371  hypothetical protein  36.48 
 
 		 431 aa  178  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1822  hypothetical protein  27.41 
 
 		 416 aa  53.9  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000473849  normal  0.0325575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6390  hypothetical protein  28.07 
 
 		 422 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>