16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3189 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3189  hypothetical protein  100 
 
 		 428 aa  806    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.127447  hitchhiker  0.0000558428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3937  membrane protein  36.11 
 
 		 808 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183856  normal  0.16689 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1062  membrane protein  36.3 
 
 		 615 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0559  hypothetical protein  35.14 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.309462  normal  0.837704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0791  O-antigen and teichoic acid-like export protein  34.59 
 
 		 1273 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.750231  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2389  putative integral membrane protein  37.78 
 
 		 454 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00613681  normal  0.0209947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0371  hypothetical protein  37.28 
 
 		 431 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5068  hypothetical protein  29.54 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4607  hypothetical protein  29.23 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.031077 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2502  O-antigen and teichoic acid-like export protein  32.89 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5106  hypothetical protein  27.64 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1822  hypothetical protein  33.56 
 
 		 416 aa  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00000473849  normal  0.0325575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4583  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.358999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5044  polysaccharide biosynthesis protein  29.41 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.740829  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6390  hypothetical protein  27.54 
 
 		 422 aa  46.6  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1699  O-antigen and teichoic acid-like export protein  31.88 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0654508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>