24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2162 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2162  HNH endonuclease  100 
 
 
250 aa  522  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.097975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  40.3 
 
 
170 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  39.06 
 
 
199 aa  47  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  38.03 
 
 
174 aa  47  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  43.06 
 
 
585 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  41.27 
 
 
177 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  29.84 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  39.06 
 
 
171 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  37.5 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  39.06 
 
 
180 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  35.94 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  37.5 
 
 
177 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  37.5 
 
 
177 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  65.62 
 
 
177 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2722  HNH nuclease  40 
 
 
91 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  32.86 
 
 
178 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  36 
 
 
169 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  34.33 
 
 
80 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  40 
 
 
170 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  34.33 
 
 
80 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  34.33 
 
 
81 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  39.06 
 
 
167 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  32.29 
 
 
181 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  34.38 
 
 
186 aa  42  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>