More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2093 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2093  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  100 
 
 
307 aa  599  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31980  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  71.23 
 
 
319 aa  384  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  66.22 
 
 
323 aa  328  9e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4279  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  60.54 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.252363 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0082  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  57.44 
 
 
291 aa  279  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4714  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  61.22 
 
 
298 aa  275  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0622826  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0635  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  57.53 
 
 
304 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3424  L-aspartate oxidase  50.89 
 
 
847 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.714369  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4982  L-aspartate oxidase  52.31 
 
 
872 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.139304  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4484  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  52.63 
 
 
293 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3164  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  52.67 
 
 
282 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00339828  hitchhiker  0.00016604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2012  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  50.89 
 
 
287 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0463  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  51.7 
 
 
300 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8380  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  52.22 
 
 
302 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  50.52 
 
 
863 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2800  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  52.13 
 
 
285 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  48.64 
 
 
311 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0809106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2883  L-aspartate oxidase  50.69 
 
 
867 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.401949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11612  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  49.82 
 
 
285 aa  231  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.588375  normal  0.382236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3617  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  49.65 
 
 
287 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142575  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2964  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  47 
 
 
301 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0194  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  43.51 
 
 
296 aa  216  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2415  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.49 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741322  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1577  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  41.81 
 
 
275 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1181  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  49.29 
 
 
283 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5728  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  48.1 
 
 
287 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150246  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1245  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  46.76 
 
 
291 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1105  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  45.05 
 
 
291 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  46.42 
 
 
304 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0653  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  44.37 
 
 
275 aa  209  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1005  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  44.29 
 
 
289 aa  208  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.257167  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1774  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  45.64 
 
 
287 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.318178  normal  0.636638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3083  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  48.23 
 
 
288 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.199001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0752  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.16 
 
 
279 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1962  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  42.56 
 
 
298 aa  206  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10850  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase (carboxylating)  49.82 
 
 
290 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1475  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  45.52 
 
 
276 aa  205  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.137856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1227  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  44.37 
 
 
291 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0197  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  52.45 
 
 
342 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4340  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  44.03 
 
 
292 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  0.0824992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3066  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  47.87 
 
 
288 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0533446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0371  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  40.64 
 
 
285 aa  203  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.398309  hitchhiker  0.000104956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3126  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  47.87 
 
 
288 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.469319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3435  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.38 
 
 
293 aa  203  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128506  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2530  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  42.7 
 
 
283 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2117  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  42.46 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.498156  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002547  quinolinate phosphoribosyltransferase (decarboxylating)  40.36 
 
 
295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2321  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  43.06 
 
 
276 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100602  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  46.62 
 
 
287 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1998  quinolinate phosphoribosyltransferase  42.91 
 
 
296 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0378  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.51 
 
 
279 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2354  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  41.38 
 
 
277 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2555  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  45.49 
 
 
283 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00640  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  41.18 
 
 
280 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0415  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.46 
 
 
294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1316  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  42.7 
 
 
275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000271836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0384  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.86 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0779  quinolinate phosphoribosyltransferase  41.64 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.188315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  41.96 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2139  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  41.1 
 
 
291 aa  196  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2217  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  44.17 
 
 
285 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2190  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  42.46 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.989593  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3387  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  38.97 
 
 
291 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6035  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  43.01 
 
 
298 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227072  normal  0.478221 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2251  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  44.16 
 
 
284 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.406273  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1263  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  42.07 
 
 
287 aa  195  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1902  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  42.01 
 
 
276 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.493343 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0647  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  38.06 
 
 
275 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.173443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0427  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  38.59 
 
 
301 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0665225  hitchhiker  0.000917857 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2628  quinolinate phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 
299 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0226  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  43.16 
 
 
288 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4755  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  46.43 
 
 
282 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196687  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3421  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.39 
 
 
295 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1371  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  41.96 
 
 
299 aa  193  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.649908  normal  0.447596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1367  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  38.63 
 
 
283 aa  193  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.216555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3497  quinolinate phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 
302 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1040  quinolinate phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 
302 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.283237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3369  quinolinate phosphoribosyltransferase  40.58 
 
 
302 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.861574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0688  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  40.15 
 
 
277 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139091  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1198  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  40.85 
 
 
280 aa  192  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.963404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4813  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  36.55 
 
 
298 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0798  Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  42.7 
 
 
285 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4311  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  43.6 
 
 
285 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.608863  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03467  quinolinate phosphoribosyltransferase  39.15 
 
 
295 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0439  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  42.96 
 
 
296 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0936671 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0667  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  42.65 
 
 
296 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0602  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  40.75 
 
 
286 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.649104  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1214  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.16 
 
 
278 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00785596  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0634  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  40.83 
 
 
286 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0688  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  40 
 
 
290 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0107  nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating)  38.06 
 
 
276 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1541  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  44.29 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0184  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  37.72 
 
 
274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2774  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  44.48 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.109833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2010  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  38.08 
 
 
274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1158  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  38.16 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000773336  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2308  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  39.16 
 
 
282 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4632  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  42.55 
 
 
285 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0821  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  35.09 
 
 
276 aa  189  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4430  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  43.97 
 
 
283 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>