61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1929 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1929  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 314 aa  594  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0753  high-affinity nickel-transporter  55.12 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000315045  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1737  high-affinity nickel-transporter  46.73 
 
 		 360 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  35.22 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2976  high-affinity nickel-transporter  38.19 
 
 		 342 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  31.1 
 
 		 398 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
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NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  37.94 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
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NC_007958  RPD_0860  high-affinity nickel-transporter  32.14 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.474349 
 
 
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NC_007643  Rru_A1753  high-affinity nickel-transporter  36.91 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  32.74 
 
 		 359 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  39.02 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  33.83 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  33.68 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  32.45 
 
 		 358 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
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NC_011312  VSAL_I1976  putative nickel transporter  28.41 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_3031  high-affinity nickel-transporter  32.04 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  32.93 
 
 		 340 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
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NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  30.8 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  30.8 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  30.8 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  32.05 
 
 		 351 aa  99.8  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004311  BRA0096  hypothetical protein  30.21 
 
 		 367 aa  99.4  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A0088  hypothetical protein  30.21 
 
 		 360 aa  99.4  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_3208  high-affinity nickel-transporter  33.57 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  31.18 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1782  high-affinity nickel-transporter  31.64 
 
 		 346 aa  93.2  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009668  Oant_4249  high-affinity nickel-transporter  27.04 
 
 		 367 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1234  high-affinity nickel-transporter  29.35 
 
 		 357 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
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NC_008309  HS_1079  permease  26.95 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0887396  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  30.31 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  28.06 
 
 		 389 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0277  high-affinity nickel-transporter  38.68 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66329  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  30.93 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  30.93 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  30.93 
 
 		 328 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  30.51 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_3041  high-affinity nickel-transporter  30.04 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.167253  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2905  high-affinity nickel-transporter  28.85 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2245  high-affinity nickel-transporter  36.32 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_1678  high-affinity nickel-transporter  34.45 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0510109  normal  0.482809 
 
 
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NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  30.08 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1398  high-affinity nickel-transporter  34.75 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0677472  normal  0.0633291 
 
 
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NC_010172  Mext_1403  high-affinity nickel-transporter  37.02 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198577  normal  0.0338124 
 
 
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NC_010581  Bind_0081  high-affinity nickel-transporter  29.32 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.940198 
 
 
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NC_009720  Xaut_0391  high-affinity nickel-transporter  31.91 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335647  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  30.34 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
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NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  24.57 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
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NC_011004  Rpal_0942  high-affinity nickel-transporter  36.03 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0338054  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_1353  putative high affinity nickel transporter  39.06 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.85251  normal  0.315811 
 
 
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NC_010511  M446_2333  high-affinity nickel-transporter  34.67 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144614  normal  0.152273 
 
 
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NC_009715  CCV52592_0096  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  24.12 
 
 		 505 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00355357  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  23.44 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  23.81 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
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NC_009802  CCC13826_1792  tRNA pseudouridine synthase B  25 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 		 236 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
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NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  18.93 
 
 		 490 aa  50.1  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_2968  hypothetical protein  29.84 
 
 		 377 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.169755 
 
 
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NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  26.75 
 
 		 447 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  27.52 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
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NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  19.7 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  30.32 
 
 		 376 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
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