19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0359 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  239  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.91 
 
 
114 aa  88.2  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.18 
 
 
110 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  37.84 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  37.84 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  37.84 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  28.18 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  36.94 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.27 
 
 
116 aa  67  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  36.04 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  34.23 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  35.14 
 
 
115 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.84 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  30 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  27.52 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  30.63 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  26.36 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1143  hypothetical protein  28.89 
 
 
128 aa  40.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>