18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0181 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 184 aa  366  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  40.8 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.35 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0281  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 152 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  26.85 
 
 		 146 aa  48.9  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  30.56 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  29.66 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  25.74 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  38.71 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10448  hypothetical protein  23.12 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>