More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5926 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  46.05 
 
 		 784 aa  650    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  46.05 
 
 		 784 aa  650    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  46.13 
 
 		 768 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  44.25 
 
 		 807 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  46.41 
 
 		 819 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.82 
 
 		 784 aa  650    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  45.37 
 
 		 786 aa  650    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  45.01 
 
 		 781 aa  644    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_002978  WD0317  ATP-dependent protease La  43.07 
 
 		 817 aa  647    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  45.57 
 
 		 806 aa  653    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  44.78 
 
 		 773 aa  653    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  45.8 
 
 		 785 aa  653    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  45.17 
 
 		 810 aa  647    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  45.8 
 
 		 785 aa  649    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  44.78 
 
 		 798 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  44.49 
 
 		 776 aa  653    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.62 
 
 		 776 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  44.49 
 
 		 776 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  44.56 
 
 		 810 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  44.79 
 
 		 820 aa  685    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  44.49 
 
 		 815 aa  641    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  46.14 
 
 		 817 aa  680    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  45.53 
 
 		 785 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  42.27 
 
 		 809 aa  655    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  45.68 
 
 		 803 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  45.92 
 
 		 821 aa  665    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  45.94 
 
 		 815 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  44.93 
 
 		 805 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  44.75 
 
 		 808 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  46.05 
 
 		 784 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  44.65 
 
 		 772 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  45.43 
 
 		 789 aa  650    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  46.13 
 
 		 817 aa  702    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  45.64 
 
 		 802 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  46.94 
 
 		 780 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  45.63 
 
 		 801 aa  641    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  44.58 
 
 		 796 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  46.65 
 
 		 786 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  44.17 
 
 		 805 aa  659    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  45.42 
 
 		 774 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  46.94 
 
 		 823 aa  693    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2218  Lon-A peptidase  44.5 
 
 		 819 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  48.19 
 
 		 809 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  42.3 
 
 		 815 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  44.78 
 
 		 773 aa  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  45.54 
 
 		 785 aa  653    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  46.05 
 
 		 836 aa  666    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  43.72 
 
 		 815 aa  687    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  46.33 
 
 		 768 aa  674    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  45.35 
 
 		 805 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  48.37 
 
 		 843 aa  713    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  43.51 
 
 		 812 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  44.43 
 
 		 812 aa  651    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  43.38 
 
 		 817 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  45.77 
 
 		 802 aa  651    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  46.05 
 
 		 784 aa  653    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  46.74 
 
 		 797 aa  681    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  42.22 
 
 		 816 aa  636    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  44.06 
 
 		 823 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  44.44 
 
 		 811 aa  658    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  46.24 
 
 		 792 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  45.8 
 
 		 784 aa  653    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  46.05 
 
 		 784 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  44.88 
 
 		 783 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  44.26 
 
 		 812 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  45.18 
 
 		 802 aa  647    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  43.89 
 
 		 807 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  45.18 
 
 		 810 aa  694    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  45.53 
 
 		 784 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.3 
 
 		 784 aa  644    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  44.6 
 
 		 785 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  45.29 
 
 		 814 aa  665    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  45.12 
 
 		 802 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  45.57 
 
 		 813 aa  639    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  44.79 
 
 		 807 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  45.49 
 
 		 798 aa  648    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  46.15 
 
 		 835 aa  668    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  44.37 
 
 		 788 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  46.16 
 
 		 801 aa  673    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 		 813 aa  644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  43.94 
 
 		 776 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  43.97 
 
 		 776 aa  654    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  43.73 
 
 		 803 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  45.28 
 
 		 785 aa  643    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  45.15 
 
 		 785 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  45.02 
 
 		 813 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  44.74 
 
 		 783 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  44.56 
 
 		 812 aa  664    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  46.21 
 
 		 856 aa  675    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  45.8 
 
 		 785 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  44.58 
 
 		 806 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  49.08 
 
 		 828 aa  718    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  43.36 
 
 		 815 aa  639    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  45.61 
 
 		 790 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  44.72 
 
 		 783 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  45.02 
 
 		 785 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  46.35 
 
 		 823 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  45.11 
 
 		 771 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  44.52 
 
 		 805 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44.23 
 
 		 785 aa  636    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>