20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5613 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5613  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716122  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3374  hypothetical protein  48.33 
 
 
176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0121644  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3456  hypothetical protein  44.53 
 
 
173 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0470029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3392  hypothetical protein  44.53 
 
 
173 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3312  hypothetical protein  47.75 
 
 
176 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0872079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1406  hypothetical protein  26.75 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1554  hypothetical protein  30.67 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0826077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1816  hypothetical protein  36.28 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1305  hypothetical protein  27.06 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.513328  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07661  hypothetical protein  30.21 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.411925  hitchhiker  0.00185927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4919  hypothetical protein  32.65 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  32.14 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00646498 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3170  hypothetical protein  33.61 
 
 
229 aa  51.6  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0730  hypothetical protein  22.38 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2179  hypothetical protein  39.29 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.419908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1142  hypothetical protein  27.82 
 
 
229 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0728659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0250  hypothetical protein  24.68 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0702  hypothetical protein  24.79 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13180  hypothetical protein  23.91 
 
 
231 aa  45.4  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.731417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0241  hypothetical protein  24.22 
 
 
224 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0225517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>