122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4338 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4338  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  255  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0311  glutaredoxin  49.56 
 
 
126 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4060  glutaredoxin  46.28 
 
 
127 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0010  glutaredoxin  48.31 
 
 
121 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  28.71 
 
 
110 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  33.68 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  27.72 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  27.72 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  32.04 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  33.67 
 
 
110 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  30.1 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  28.16 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  32.35 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  30.1 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  30.1 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  30.1 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  30.1 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  30.1 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  30.1 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  30.1 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  30.61 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  31.07 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1122  glutaredoxin-like protein  25.71 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.160765  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  31.07 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  31.07 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12171  glutaredoxin-like protein  24.74 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  31.07 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  32.69 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  26.53 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12181  glutaredoxin-like protein  25.71 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  30.1 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  30.1 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51060  glutaredoxin-related protein  34.95 
 
 
109 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0783867  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9035  predicted protein  35.11 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  31.37 
 
 
103 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  30.39 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  30.39 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  30.1 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  27.55 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  30.1 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1034  glutaredoxin-like protein  25.49 
 
 
108 aa  45.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000907202  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12021  glutaredoxin-like protein  23.3 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  28.57 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352705  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  27.72 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  27.62 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02749  putative glutaredoxin like protein  27.91 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2225  monothiol glutaredoxin  28.85 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  29.13 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02424  putative glutaredoxin-like protein, putative  31.71 
 
 
308 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1640  glutaredoxin-like protein  24.27 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000518322  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40414  predicted protein  47.62 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0558795  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0701  glutaredoxin-like protein  23.21 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.244741  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  30.1 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1748  glutaredoxin-like protein  25.24 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425193  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  30.19 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2880  glutaredoxin domain-containing protein  25.24 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  29.7 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1610  glutaredoxin-like protein  32.05 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1835  glutaredoxin-like protein  26.17 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  0.937939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1688  glutaredoxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0596  glutaredoxin-like protein  29.63 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.097988  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  29.27 
 
 
308 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  29.27 
 
 
308 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1820  glutaredoxin-like protein  26.21 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  26.53 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1573  glutaredoxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  43.5  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000259728  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1648  glutaredoxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  43.5  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000432966  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1640  glutaredoxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  43.5  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000581694  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  32.31 
 
 
112 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  28.16 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1783  glutaredoxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000151147  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1776  glutaredoxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000936402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2502  glutaredoxin-like protein  25.24 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000230073  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1661  glutaredoxin-like protein  32.47 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.147009  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27972  predicted protein  26.85 
 
 
338 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8492  predicted protein  28.92 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00589447  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0134  glutaredoxin-like protein  28.57 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00271929  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  30.61 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0639  glutaredoxin-like protein  24.75 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  28.77 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0302  glutaredoxin-related protein  22.73 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.354475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1396  glutaredoxin-like protein  24.53 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.420177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  31.25 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002935  glutaredoxin-related protein  28.57 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000192998  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  29.58 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  30.99 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14711  glutaredoxin-like protein  24.75 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.211551  normal  0.903864 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37615  glutaredoxin  30 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0697  glutaredoxin family protein  29.59 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000299958  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  29.58 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1145  glutaredoxin-like protein  32.81 
 
 
108 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  26.58 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09521  glutaredoxin-like protein  28.75 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03013  hypothetical protein  28.57 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3466  glutaredoxin-like protein  27.59 
 
 
113 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147483  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  39.53 
 
 
112 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2134  glutaredoxin-like protein  27.88 
 
 
104 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.681937  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05590  thioredoxin, putative  34.29 
 
 
242 aa  41.2  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.32051  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46670  Glutaredoxin  32.18 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.818078  normal  0.747519 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>