22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1973 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1025    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  25.43 
 
 		 552 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  26.21 
 
 		 551 aa  133  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  26.58 
 
 		 551 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  27 
 
 		 558 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  24.33 
 
 		 551 aa  123  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  24.59 
 
 		 552 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  24.91 
 
 		 545 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  25.82 
 
 		 550 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  28.89 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  26.08 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  26.2 
 
 		 578 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  27.21 
 
 		 545 aa  75.9  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  25.42 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  20.83 
 
 		 555 aa  67.4  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  21.57 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  25.96 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  25.8 
 
 		 586 aa  57  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  22.75 
 
 		 509 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  24.28 
 
 		 550 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  33.9 
 
 		 788 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  32.46 
 
 		 517 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>