250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1908 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1908  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  100 
 
 
519 aa  1024    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0662  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  54.42 
 
 
460 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0650  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  54.22 
 
 
460 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0123191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0367  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  52.77 
 
 
465 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.541099  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4040  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.3 
 
 
468 aa  442  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4703  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.91 
 
 
468 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00565562  normal  0.677094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2241  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.92 
 
 
468 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2170  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.42 
 
 
486 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4267  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.71 
 
 
464 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3106  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.8 
 
 
464 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3428  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.51 
 
 
467 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0680  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.31 
 
 
467 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3207  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.8 
 
 
464 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.254389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3007  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.2 
 
 
464 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2894  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.21 
 
 
475 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2005  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.01 
 
 
481 aa  410  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2973  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.48 
 
 
462 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.719312  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3202  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.82 
 
 
475 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232806  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1610  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  48.82 
 
 
470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.181074  normal  0.230255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.44 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03896  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  47.23 
 
 
449 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.49 
 
 
467 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.94 
 
 
465 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.09 
 
 
472 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3654  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.82 
 
 
461 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.96 
 
 
472 aa  392  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.58 
 
 
469 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.56 
 
 
466 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.58 
 
 
465 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.44 
 
 
464 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.24 
 
 
470 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.44 
 
 
464 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.64 
 
 
494 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.64 
 
 
494 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.64 
 
 
494 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.42 
 
 
494 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3066  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.4 
 
 
494 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00270245  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0624  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.71 
 
 
458 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.84 
 
 
482 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3418  pyridine nucleotide transhydrogenase  44 
 
 
494 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.88 
 
 
466 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284684  normal  0.879821 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.88 
 
 
466 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4185  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.6 
 
 
464 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283552  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3668  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.25 
 
 
464 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182958  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4578  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.58 
 
 
471 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  0.4459 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0937  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  46 
 
 
465 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0907  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  46 
 
 
465 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0951  pyridine nucleotide transhydrogenase  44 
 
 
494 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0917  pyridine nucleotide transhydrogenase  44 
 
 
494 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2988  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.84 
 
 
466 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.88 
 
 
466 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0233  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.74 
 
 
486 aa  375  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.448923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0942  pyridine nucleotide transhydrogenase  44 
 
 
494 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.51 
 
 
472 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4666  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.2 
 
 
465 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0192  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.69 
 
 
473 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.483565  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0930  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.6 
 
 
494 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.339922  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1381  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.9 
 
 
493 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.72978  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3195  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.69 
 
 
494 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  44.36 
 
 
478 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  44.27 
 
 
462 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.437932  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.77 
 
 
484 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.97 
 
 
484 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2761  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.93 
 
 
466 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  42.18 
 
 
470 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.36 
 
 
467 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  44.36 
 
 
478 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.13 
 
 
470 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2120  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  41.42 
 
 
467 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228007  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13101  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  43.9 
 
 
478 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1784  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.07 
 
 
469 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0971  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.8 
 
 
466 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0207  NAD(P) transhydrogenase beta subunit  44.22 
 
 
465 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0997  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  45.6 
 
 
465 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.38 
 
 
471 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.05 
 
 
455 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0911  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.8 
 
 
466 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.33 
 
 
470 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0565  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.41 
 
 
458 aa  368  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3142  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.62 
 
 
465 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583336  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12191  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  43.95 
 
 
477 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.48318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4537  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.42 
 
 
502 aa  364  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  42.45 
 
 
458 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4747  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.19 
 
 
477 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1386  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.95 
 
 
466 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1516  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.65 
 
 
455 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15909  normal  0.640123 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1242  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  43.56 
 
 
479 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.69 
 
 
464 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.8 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  41.8 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.8 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  41.8 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2965  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  42.86 
 
 
490 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.8 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.8 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.8 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.8 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.57 
 
 
470 aa  363  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2798  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.02 
 
 
465 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.85456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.55 
 
 
478 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>