37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1306 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1306  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  512  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1387  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
223 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3216  hypothetical protein  31.71 
 
 
249 aa  92  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0455432  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3889  hypothetical protein  32.89 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0449106  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2525  hypothetical protein  39.01 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0433419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4766  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1337  hypothetical protein  36.36 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3407  hypothetical protein  30.93 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00706762  normal  0.230528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1724  hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0653  hypothetical protein  30.94 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4476  hypothetical protein  31.65 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4418  hypothetical protein  28.88 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0777  hypothetical protein  32.74 
 
 
183 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1741  hypothetical protein  32.74 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0691  hypothetical protein  32.74 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2416  hypothetical protein  32.74 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1213  hypothetical protein  32.74 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0125495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1138  hypothetical protein  32.74 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2910  putative RNA methylase  36.89 
 
 
210 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.094641 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  30.99 
 
 
165 aa  46.6  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.1 
 
 
387 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.1 
 
 
387 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  27.1 
 
 
387 aa  45.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1135  hypothetical protein  22.68 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4928  hypothetical protein  26.72 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1943  methyltransferase small  30.98 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.062516  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1838  cyclopropane fatty acid synthase  26.16 
 
 
434 aa  43.5  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0437  hypothetical protein  26.09 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0437  hypothetical protein  26.96 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2169  methyltransferase small  39.71 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0323  methyltransferase  26.09 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0390  hypothetical protein  26.09 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0315  methyltransferase  26.09 
 
 
202 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0375  hypothetical protein  26.96 
 
 
202 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0343  hypothetical protein  26.72 
 
 
202 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0312  methyltransferase  26.72 
 
 
202 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0328  hypothetical protein  26.72 
 
 
202 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0787976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>