170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1279 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  100 
 
 		 142 aa  298  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  53.91 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  50.39 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  52.54 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  51.3 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  50.43 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  49.58 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  45.16 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  45.16 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  48.28 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  49.18 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  47.83 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  46.88 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  50 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  45.45 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  45.45 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  47.24 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  48.74 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  48.74 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  48.74 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  48.74 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  49.57 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  48.74 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  45.38 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  47.83 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  48.74 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  48.74 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  48.74 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  46.96 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  47.24 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  48.74 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  48.74 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0438  ApaG  46.88 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  47.06 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0304  ApaG  46.72 
 
 		 130 aa  114  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0380419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0562  ApaG  46.67 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  48.7 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3210  ApaG  44.63 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  46.09 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0402  ApaG  46.88 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0370  ApaG  46.88 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.292548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  45.9 
 
 		 140 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  46.22 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3080  ApaG  45.9 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3833  ApaG  44.17 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  48.7 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  44.83 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  45.69 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  45.22 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3636  ApaG  45.83 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0317  ApaG  45.9 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  48.7 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  46.09 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  43.41 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0093  ApaG  47.06 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.574173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0100  ApaG  47.06 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.819852  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0095  ApaG  47.06 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0976  ApaG  44.63 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13666  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0098  ApaG  47.06 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  46.09 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1045  ApaG  44.63 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.102627  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0094  ApaG  47.06 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237472  normal  0.301698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1078  ApaG  44.63 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.804618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3314  ApaG  44.63 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  46.09 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0599  ApaG  47.83 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.121399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  44.63 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0601  ApaG  45.83 
 
 		 125 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  48.67 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  46.09 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0397  ApaG  45.08 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  47.79 
 
 		 185 aa  110  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1013  ApaG  46.61 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156243  hitchhiker  0.00045551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  45.08 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3640  ApaG  43.8 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4913  ApaG  46.72 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  47.79 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  45.08 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  47.41 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  44.92 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  47.79 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  44.26 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  47.41 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  48.28 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  49.53 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0130  ApaG  43.44 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.431164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0963  ApaG  45.69 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0135  ApaG  46.34 
 
 		 237 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.903636  normal  0.829835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0543  ApaG  42.62 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  44.35 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>